- 黄红宝;何应会;黄欣;孙开道;秦波;黄耀恒;
铁冬青(Ilex rotunda)是具有多种应用价值的植物,为丰富其分子生物学信息及进一步明确系统位置,应用Illumina Novaseq 6000测序平台对其叶绿体基因组进行测序,组装获得了完整叶绿体基因组;并进行了基本特征分析、SSR特征分析,同时基于同源蛋白序列构建了包括铁冬青在内的33个物种的系统发育树。结果表明:(1)铁冬青叶绿体基因组大小为157,778 bp,其中IRs长度为26,124 bp, LSC长度为87,092 bp, SSC长度为18,438 bp,全基因组GC含量为37.70%,共编码131个基因;(2)共检测到131个SSR,其中大多数为单核苷酸SSR,共120个,占总体的91.60%;(3)系统发育分析表明铁冬青隶属于冬青亚属(Subgen. Ilex)单序冬青组(Sect. Lioprinus),与毛冬青(I. pubescens)和网脉多脉冬青(I. polyneura)亲缘关系较近。研究结果可为冬青科种质资源的鉴定,叶绿体基因组的利用及后续研究等提供理论依据。
2022年05期 v.35;No.201 7-14页 [查看摘要][在线阅读][下载 1140K] [下载次数:158 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:2 ] |[阅读次数:1 ] - 徐友阳;王德勤;李静宇;梅瑜;王继华;蔡时可;
本研究通过高通量转录组测序和生物信息学分析获得显齿蛇葡萄的转录表达数据,提取显齿蛇葡萄叶片和茎的总RNA (Ribonucleic Acid,核糖核酸)、建库、测序、组装,注释和比对等生物信息分析技术得到显齿蛇葡萄转录组的遗传信息。共检测到23,208,741个高质量的Reads,对数据进行Denovo组装后,获得43,603个Unigene,其中Unigene的N50长度为1580 bp,平均长度为1000.2 bp。在KOG、GO、KEGG、NR、SwissProt数据库中进行比对,得到注释的有25714个(58.97%) Unigene。其中25,801个Unigene在Nr数据库中得到注释,15,934个Unigene在KEGG数据库中得到注释,涉及135条代谢通路。在显齿蛇葡萄中我们共鉴定到75个Unigene涉及黄酮类生物合成,其中参与黄酮和黄酮醇生物合成的Unigene有4个,参与异黄酮生物合成的Unigene有13个。同时还检测到922个转录因子(Transcription factors, TFs)。采用MISA (Microsatellite identification tool)对组装的1000 bp以上的unigene分析发现,4771个Unigene包含5869个简单重复序列(Simple sequence repeats, SSRs),并使用Primer 3.0设计引物。利用高通量测序和生物信息学分析获得了显齿蛇葡萄的转录组信息特征,转录组数据为显齿蛇葡萄的重要功能基因鉴定,次生代谢通的挖掘奠定了研究基础。
2022年05期 v.35;No.201 15-23页 [查看摘要][在线阅读][下载 1618K] [下载次数:221 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:1 ] |[阅读次数:3 ] - 陈仕昌;董利军;程琳;陈琴;梁瑞龙;戴俊;姜英;余代渊;黄开勇;
为研究红椿不同种源嫁接成活率、萌发时间和新梢生长差异,开展红椿不同种源嫁接试验。结果表明:四川攀枝花种源的嫁接成活率最高,为93.33%,最低的是广西浦北种源,嫁接成活率仅为38.89%;嫁接后萌发时间最长的是广西西林种源,为27 d,最短的为广西浦北种源,为21 d;云南富宁种源在整个试验期内,其新梢长度均高于其它5个种源。嫁接2个月后,云南富宁种源新梢的平均长度最大,为4.83 cm,新梢生长量最小的是四川攀枝花种源,为2.82 cm。
2022年05期 v.35;No.201 24-28页 [查看摘要][在线阅读][下载 1218K] [下载次数:93 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:1 ] |[阅读次数:1 ] - 农艳丰;李健;
本研究以紫玉淮山带腋芽的茎段为外植体进行组培快繁技术探讨。结果表明:对紫玉淮山茎段的灭菌处理及诱导效果,以中上部茎段0.1%升汞处理4~8 min为宜,存活率高,污染率和褐化率低,灭菌效果好,同时诱导萌芽效果较好。初代培养基以MS+3 mg/L KT较好;继代腋芽培养增殖率最佳的培养基为MS+KT 3 mg/L+NAA 0.1~0.2 mg/L;生根培养基宜选用1/2 MS+NAA 0.5mg/L;移栽基质为蛭石与营养土配比1:3。建立的组培快繁体系可为紫玉淮山工厂化生产种苗提供技术基础。
2022年05期 v.35;No.201 29-34页 [查看摘要][在线阅读][下载 1401K] [下载次数:121 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:0 ] |[阅读次数:1 ] - 林雪燕;侯健;金睿哲;薛秋华;
以蝶豆幼苗为试验材料,利用智能光照培养箱对其进行温度处理,研究不同温度下蝶豆形态和生理变化。结果表明:低温5℃下蝶豆嫩梢下垂、新叶闭合;高温45℃下蝶豆嫩梢下垂。以25℃作为对照组,随着温度降低,蝶豆的SOD活性、MDA含量、可溶性糖含量、可溶性蛋白含量先升高后下降;CAT、POD活性先下降后上升;光合色素含量升高,细胞膜透性增大。随着温度升高,蝶豆的SOD、可溶性糖含量先上升后下降,POD、CAT活性、MDA含量、细胞膜透性和可溶性蛋白含量先下降后上升;光合色素呈波浪形变化。低温或高温下的Pro含量均呈先上升后下降再上升趋势。结合形态观察与生理生化指标变化,初步认定蝶豆幼苗生长温度适应区间为15~40℃,蝶豆对低温变化反应较为敏感。研究结果为蝶豆的应用和推广提供理论参考依据。
2022年05期 v.35;No.201 35-42页 [查看摘要][在线阅读][下载 1674K] [下载次数:112 ] |[网刊下载次数:0 ] |[引用频次:2 ] |[阅读次数:1 ]